Wewnątrz murów wzniesiono bowiem około 1125 roku \"twierdzę w twierdzy\"-warowny zamek hrabiowski. Od zachodu przylega on do murów i jest zaopatrzony we własną fosę, pięć baszt oraz drewniane ganki obronne wokół murów. Wewnątrz pierścienia fortyfikacji znajduje się bazylika Saint Nazaire wzniesiona w latach 1096-1150 jako halowy kościół romański, a następnie rozbudowana w stylu gotyckim w XIII wieku.
Mniej więcej w tym samym czasie założono na planie pięcioboku dolne miasto posiadające regularną siatkę ulic i placów. Z czasem tam właśnie skoncentrowało się całe życie Carcassonne, co doprowadziło do całkowitego upadku Cite. W XIX wieku zamierzano nawet wyburzyć średniowieczne fortyfikacje, aby uzyskać miejsce na realizację nowych budowli. Tym absurdalnym planom przeciwstawił się jednak znany pisarz Prosper Merimee-pełniący w tym okresie funkcję inspektora ochrony pamiątek historycznych Francji-i doprowadził do rozpoczęcia plac renowacyjnych jednego z najcenniejszych zabytków Europy.